Compétences

• Taxonomie et identification poly-phasique de microorganismes à intérêts biotechnologiques (médicale, vétérinaire, agro-alimentaire, etc) (équipe 1):
  
  
• Amélioration des techniques de sélection des actinomycètes (y compris les plus rares au monde) en faisant varier les milieux, les agents sélectifs et les traitements des sols de divers écosystèmes sahariens.
• Sélectionner les actinomycètes (en focalisant plus sur ceux appartenant à des genres rares ou peu fréquents dans le monde, tout en n’excluant pas les autres), afin de les déterminer.

• Etude de la taxonomie des actinomycètes par des méthodes classiques (morphologie, physiologie, chimiotaxonomie) et moléculaire (Séquençage de l’ADNr 16S, phylogénie, hybridation ADN-ADN et détermination du GC%.

• Evaluation des potentialités antagonistes contres des germes pathogènes par des méthodes classiques (Stries croisées, et autres) et moléculaires par un screening des gènes « polyketide synthases » (PKS) et « nonribosomal peptide synthetases » (NRPS).

• Essai in vitro et in vivo d'agents microbiens et de molécules bioactives à visées agronomiques (bio-intrants de type bio-pesticides et bio-fertilisants) (équipe 2):
  • Valorisation du potentiel de production d’antibiotiques par les actinomycètes des sols sahariens et recherche de nouvelles molécules actives à intérêt agronomique.

• Lutte biologique contre les maladies des plantes d’origine fongique (ou même bactérienne) par l’utilisation de souches d’actinomycètes sélectionnées et performantes. Les plantes peuvent être des légumineuses, des céréales et diverses plantes maraichères.

• Exploitation de l’utilisation des actinomycètes endophytes pour la promotion de certaines plantes sahariennes et steppiques d’intérêt (plantes médicinales, plantes utilisées dans la lutte contre la désertification, etc.).

• Screening de micro-organismes producteurs d'antibiotiques à application humaine, animale et agronomique (équipe 3):

• Sélection des souches d’actinomycètes (isolés par les chercheurs de l’équipe 1) les plus actives contre des microorganismes pathogènes pour l’homme ou zoopathogènes (bactéries, champignons filamenteux et levures). 

• Cinétique de production des antibiotiques en milieux de culture agités et optimisation de la production en shaker et en fermenteur.

• Choix des solvants d’extraction des fractions actives et révélations de ces dernières par des méthodes microbiologiques (bioautographie) et chimiques.

• Criblage des antibiotiques polyéniques et non polyéniques par spectroscopie UV-visible. 

• Purification des antibiotiques par chromatographie préparative sur plaques épaisses de gel de silice, sur colonne de gel de silice ou de Séphadex par HPLC semi-préparative sur colonne C18.

• Identification des molécules les plus intéressantes par des méthodes spectroscopiques (UV-visible, Infra-Rouge, Masse, RMN du proton et du C13 avec étude des corrélations).

• Détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) contre de nombreux agents pathogènes.

• Recherche de champignon toxinogènes, et de mycotoxines dans l'alimentation humaine et animale (équipe 4):

• Connaissances approfondies des champignons potentiellement toxinogènes impliqués dans la contamination des différentes filières alimentaires.
• Détermination des différentes conditions d’ordre biologique, chimique, physique, macro-environnementale et micro-environnementale nécessaires au développement des champignons toxinogènes et à la production des mycotoxines.

• Recherches de nouvelles techniques d’identification moléculaires des champignons toxinogènes.

• Amélioration des connaissances de l'étiologie de la production des mycotoxines.

• Définition des interventions appropriées pour maîtriser les mycotoxines et les mycotoxicoses.

 

 

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Equipement

• ETUVE UNIVERSELLE    MEMMERT         B-80
• RÉFRIGÉRATEUR COMBINE 1 PORTE     JOUAN  MAXI ARTIC
• AUTOCLAVE 65L           PBI       146216
• ROTAVAPOR     BUCHI  R-114
• ROTAVAPOR WATERBATH         BUCHI  B-480
• ROTAVAPOR     BUCHI  RE-111
• ROTAVAPOR WATERBATH         BUCHI  B-461
• INCUBATOR SHAKER    New BRUNSWICK         EXCELLA E24
• INCUBATOR SHAKER    New BRUNSWICK         CLASSIC C24
• ETUVE UNIVESELLE      MEMMERT         UM-600
• BALANCE ANALYTIQUE KERN    ABJ-220-4M
• CENTRIFUGEUSE RÉFRIGÉRÉ    JOUAN  E96
• INCUBATEUR À AGITATION ILLUMINÉ  GALLENKAMP    NR401-010W
• RÉFRIGÉRATEUR COMBINÉ 2 PORTES    LG        480L
• RÉFRIGÉRATEUR COMBINÉ 2 PORTES    ENIEM  320 L
• CONGÉLATEUR À TIROIRS        LIEBHERR         320 L
• ETUVE BACTERIOLOGIQUE       MEMMERT         BE-500
• BAIN MARIE     MEMMERT         W-87
• COMPRESSEUR D’AIR    MGF     SIL-E0L 24/50
• SONICATEUR ULTRASONS        ELMA    T-700
• MICROONDES   WHIRLPOOL     AVM 571
• MICROONDES   WHIRLPOOL     AVM 571
• RÉFRIGÉRATEUR COMBINÉ 1 PORTE     LG        GR-131 SF
• PHOTOCOPIEUR           KYOCERA MITA KM-1525
• CENTRIFUGEUSE DE PAILLASSE            SELECTA           CE-95
• SOUDEUSE PLASTIQUE PFS       PFS-300
• AGRAFEUSE GÉANTE     NOUVUS           B 52/3
• MACHINE A RELIER 2 BRAS       PAVO    ECLIPSE
• LYOPHILISATEUR         CHRIST ALPHA 1-2
• POMPE A VIDE  VACUUBRAND   RZ-2
• PC DE BUREAU CLONÉ  U. CENTRALE
• ECRAN CRT 17" LG        710E
• PC DE BUREAU CLONÉ  U. CENTRALE
• IMPRIMANTE LASER JET           CANON LBP-4i
• PC DE BUREAU CLONÉ  U. CENTRALE
• ECRAN TFT 17" HP        L1710
• IMPRIMANTE LASER JET           HP        1320
• ENDULEUR       PCM      BNT501
• ENDULEUR       EVER POWER   
• RÉGULATEUR DE TENSION       PCM      TCA2000
• ENDULEUR       PCM      BNT501
• COMPRESSEUR A AIR    BALMA  SIRIO LT24
• PC DE BUREAU CLONÉ  U. CENTRALE
• ECRAN CRT 17" MAX VIEW        NH776
• CUMULUS 80L  ARISTON          SEN80
• BOX UV            VILBER L.         CN-6
• TORCHE UV (365-254)nm          VILBER L.         VL-6.LC
• POMPE A VIDE  ILMVAC            4001021
• POMPE A VIDE  ALCATEL          1004A
• AGITATEUR MAGNETIQUE        BIOBLOCK        350-11
• AGITATEUR MAG. CHAUFFANT BIOBLOCK        94361
• RÉGULATEUR DE TENSION       PCM      TCA 2000
• BAIN MARIE A CIRCULATION    JULABO            MV-4
• CUVE DE FERMENTATION 7L     HWS     DN 200
• MOTEUR CUVE DE FERMENTATION       HELDOLPH        RZR 2051
• POMPE A AIR POUR FERMENTEUR                    
• MODULE DE CONTROL FERMENTEUR               
• POMPE A VIDE  HEIDOLPH        ROTAVAC
• HAUTE BACTERIOLOGIQUE       FLUFRANCE      REBECCA
• POMPE A VIDE  ILMVAC            400177
• ETALOIRE DESAGA       STREICHTISCH 120315
• AGITATEUR MAG. CHAUFFANT BIOBLOCK        94361
• PH METRE        HANNA PH 211
• RÉGULATEUR DE TENSION       PCM      TCA 2000
• SÉCHOIR          CERIOTTI         GEK 3000
• BRAS MIXEUR   BOSCH  CNHR8
• MOULIN A CAFÉ           -           -
• MICROSCOPE BINOCULAIRE      MOTIC  B-1
• MICROSCOPE BINOCULAIRE      ZEISS    KF-2
• POMPE POUR HPLC       PHARMACIA      P3500
• POMPE POUR HPLC       PHARMACIA      P3500
• DETECTEUR UV (1-PATH)         PHARMACIA      UV-1
• MODULE DE CONTROL  PHARMACIA      LCC-500
• INJECTEUR POUR HPLC PHARMACIA      PMV-7
• MELANGEUR POUR HPLC          PHARMACIA      35MPa
• POMPE POUR HPLC       JASCO   PU-1580
• DETECTEUR UV POUR HPLC      JASCO   UV-1575
• INJECTEUR POUR HPLC RHEODYNE (MANUEL)   7725i
• CHAMBRE POUR COLONNE HPLC           EPPENDORF      CH-30
• CHAUFFAGE POUR COLONNE HPLC       EPPENDORF      TC-50
• DÉGAZEUR POUR HPLC CAMBRIDGE Sci.           006150/4
• INTERFACE POUR CHROMATO   JMBS    HERCULE LITE
• ENDULEUR       EVER POWER    UP-010N2EJA
• COMPRESSEUR D'AIR    FERRUA            SBK/270-HP3T
• CLIMATISEUR 18000BTU          CONDOR           SPLIT
• CLIMATISEUR 18000BTU          CONDOR           SPLIT
• IMPRIMANTE DESK JET HP        690C
• ROUTEUR SANS FIL      D-LINK DIR615
• VIDEO PROJECTEUR      EPSON  EMP-S4
• IMPRIMANTE INK JET   SIEMMENS        4011-N70
• IMPRIMANTE THERMIQUE         ZEBRA  GC420T
• UNIBINDER (Reliure )               8.2 220V
• SCANNER         HP       
• T5570 WES 2GF/2GR WIFI THIN CLIENT-1        HP       
• T5570 WES 2GF/2GR WIFI THIN CLIENT-2        HP       
• T5570 WES 2GF/2GR WIFI THIN CLIENT-4        HP       
• ECRAN HP 2011X-1       HP       
• ECRAN HP 2011X-2       HP       
• T5570 WES 2GF/2GR WIFI THIN CLIENT-3        HP       
• ECRAN HP 2011X-3       HP       
• ECRAN HP 2011X-4       HP       
• ECRAN HP 2011X-5       HP       
• ONDULEUR KIN-2200 W/O BAT PACK BAT                   
• SERVEUR HP PROLIANT ML350 G6        HP       
• CLIENT LEGER              HP t5545 Thinpro 1GHz 512F/512 RTC
• ETUVE UNIVERSELLE    MEMMERT         UN 110
• INCUBATEUR-ETUVE BACTERIOLOGIQUE          MEMMERT         IN260
• PLAQUE CHAUFFANTE AVEC AGITATION MAGNETIQUE-1          STUART            US152
• PLAQUE CHAUFFANTE AVEC AGITATION MAGNETIQUE 2          STUART            US152
• LAMPE UV GERMICIDE 2X40W 254 NM  VILBERT LOURMAT       31212411
• LAMPE UV GERMICISE 2x40 W254 NM   VILBERT LOURMAT       312124011
• CAMERA POUR MICROSCOPE     ZEISS    426540-0000-0000
• Micro ordinateur de bureau 1     HP       
• MICRO ORDINATEUR DE BUREAU 2       HP       
• Micro ordinateur de bureau 3     HP       
• Micro ordinateur de bureau 4     HP       
• Micro ordinateur de bureau        HP       
• Onduleur APC Back -up  UPS ES  500Va

 

En cours de construction 

INTERACTION DU LBSM AVEC L’ENVIRONNEMENT SOCIO-ECONOMIQUE

Les objectifs du LBSM et ses travaux intéressent le secteur socio-économique, notamment la recherche de microorganismes ou de biomolécules pouvant avoir un intérêt dans le domaine agronomique (biocontrôle des maladies des plantes cultivées, amélioration de la production végétale, etc.), dans le domaine médicale, vétérinaire et pharmaceutique (recherche d’antibiotiques antibactériens et antifongiques intéressants par leur activité) et dans le domaine alimentaire (Recherche des champignons toxinogènes et des mycotoxines dans les différentes filières alimentaires. Analyse des risques de contamination par les mycotoxines et définition des mesures permettant de les maîtriser).

A ce titre, une convention a été établie entre le LBSM, par l’intermédiaire de l’ENS de Kouba, et    l’Office National des Aliments du Betail (ONAB. D’autres types de convention sont envisagées, notamment dans les domaine agronomique et sanitaire. 

 

 

 

 

 

 

LES PROJETS DE RECHERCHE DU LBSM

 

Plusieurs projets de recherche ont été réalisés par le LBSM de 2012 (année de création) jusqu’à 2015, et aussi, auparant, lorsque les membres du LBSM faisaient partie de l’équipe de Microbiologie affiliée au Laboratoire de recherche sur les Produits Bioactifs et la Valorisation de la biomasse (LPBVB) (entre janvier 2000 et décembre 2011).

 

 

•   Entre 2010 et 2015

Projet de coopération algéro-française PHC Tassili

 

- 2014-2016: Projet PHC Tassili n° 15 MDU 932 entre le LBSM (ENS de Kouba) et le Laboratoire de Génie Chimique (INP-ENSAT de Toulouse).

Intitulé: Recherche d’antibiotiques potentiellement intéressants dans les domaines pharmaceutique, alimentaire et agronomique, produits par des actinobactéries des sols sahariens. Chef de projet: Pr. Sabaou Nasserdine (côté algérien) et Mathieu Florence (côté français).

 

Projets PNR

 

- 2011-2013: projet PNR  n° 8/u23/3225.

   Intitulé: Antibiotiques des actinomycètes des sols sahariens. Chef de projet: Pr.Zitouni Abdelghani.

-2011-2013: projet PNR  n° 8/E1605/1091. 

  Intitulé: Recherche des Aspergillus toxinogènes, des aflatoxines et de l’ochratoxine A dans les céréales, les fruits secs, les légumes secs et les épices en Algérie. Chef de projet: Dr. Bouras Noureddine.

- 2011-2013 : projet PNR  n° 8/E1605/1138.

  Intitulé : Mise en valeur de la biodiversité des sols sahariens en actinomycètes et recherche de nouvelles espèces et souches productrices d’antibiotiques. Chef de projet: Pr.Sabaou Nasserdine. 

 

Projets CNEPRU

 

- 2016-2019: Six nouveaux projets CNEPRU ont été soumis en 2015 (pour la période 2016-2019): projets de Sabaou N., Zitouni A., Badji B., Riba A., Boudjella H. et Lamari L.

 

- 2013-2015: projet cnepru n° F04920120011.

Intitulé: Actinomycètes et bactéries d’origine saharienne à intérêt agronomique: isolement, taxonomie, effet PGPR et biocontrôle des maladies des plantes. Chef de projet: Pr.Zitouni Abdelghani.

- 2013-2015: projet cnepru n° n° F04920120013.

Intitulé: Recherche sur les actinomycètes producteurs d’antibiotiques actifs contre Candida albicans et Staphylococcus aureus. Chef de projet: Pr. Badji Boubekeur.

- 2013-2015: projet cnepru n° F04920120016.

Intitulé: Recherche d’antibiotiques produits par les actinomycètes des sols sahariens en vue d’une application en thérapeutique humaine. Chef de projet: Pr. Boudjella Hadjira.

- 2013-2015: projet cnepru n° F04920120005.

Intitulé: Etude de la contamination des produits alimentaires par les champignons toxinogènes et évaluation des risques. Chef de projet: Pr. Riba Amar.

- 2013-2015: projet cnepru n° F04920120007.

Intitulé: Actinomycètes des sols sahariens: diversité taxonomique et potentialités antagonistes. Chef de projet: Pr.Sabaou Nasserdine.

- 2010-2012: projet cnepru n° F04920090003.

Intitulé: Taxonomie d’actinomycètes d’origine saharienne et production d’antibiotiques à intérêt potentiel dans les domaines agronomique, agro-alimentaire, médical et vétérinaire. Chef de projet: Pr.Zitouni Abdelghani.

- 2010-2012: projet cnepru n° F04920090010.

Intitulé: Recherche des Aspergillus toxinogènes, des aflatoxines et de l’ochratoxine A dans le blé, le raisin et quelques fruits secs en Algérie. Chef de projet: Pr.Riba Amar.

 

•   Entre 2000 et 2009

Projet PHC Tassili avec l’INP-ENSAT de Toulouse (2008 à 2011 et 2002 à 2005) ; projet PURAQ Algéro-Québecois (2008 à 2010); Projets CNEPRU, ONEDD et CRSTRA.